全日制和自考的毕业证书当然是有区别的了，一个是全日制本科，一个是自考本科，证书上都会有标明。自考本科学历是国家承认的，与全日制本科的待遇没有什么大的区别，主要还是看个人和每个单位的看法，一般政府机关应该是视二者同等地位。
有途网小编个人的观点来看，如果是学生，有选择的余地的话，当选当全日制本科生，因为全日制是最正规的。
如果有途网小编是用人单位，我还是比较偏向于自考本科生，原因有如下：
1. 与全日制本科相比，自考本科出来的学生是自己实打实考出来的，宽进严出;而全日制本科，宽进严出，学生在大学里，到底是在学习还是恋爱或者是玩游戏，我们不知道。
2. 自考本科，考验的不仅是知识，还有一个人的耐力和自学能力。
3. 一般来说，大部分自考本科生比全日制本科生更有上进心。
当然，自考生也有一些方面是比不上全日制的，比如说：自考本科生没有受过正规本科学校的教育，没有感受过全日制本科的学习氛围和校园文化，所以思维上不一定有全日制本科生开阔。
自考
高等教育自学考试，简称自考，1981年经国务院批准创立，自考是对自学者进行的以学历考试为主的高等教育国家考试，自考是个人自学、社会助学和国家考试相结合的高等教育形式，自考是我国社会主义高等教育体系的重要组成部分。自考是通过国家考试促进广泛的个人自学和社会助学活动，贯彻宪法鼓励自学成才的有关规定，造就和选拔德才兼备的专门人才，提高全民族的思想道德素质和科学文化素质，以适应社会主义现代化建设的需要。
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